深圳研究生院吳雲東院士課題組在環狀多肽的結構預測上取得重要進展

時間：2016-05-12 19:42  作者：  來源：深圳研究生院

　　意昂体育3平台深圳研究生院吳雲東院士課題組最近在J.Chem.Phys.Lett.（《物理化學通訊》）上發表了最新成果：使用殘基特異性力場進行環狀多肽的準確結構預測及構象分析（Accurate Structure Prediction and Conformational Analysis of Cyclic Peptides with Residue-Specific Force Fields）🙋‍♂️。

　　多肽類藥物介於小分子和蛋白質之間🪚，同時具有兩者的一些優勢🧚‍♂️🤭，近年來越來越受到廣泛關註🧑🏽‍🦰👐🏻。與線性肽相比🏇🏽，環狀多肽有構象相對剛性👔、代謝穩定性好、易 穿過生物膜等獨特的優勢，並且很多天然活性物質都是環狀多肽。環狀多肽的活性依賴於其三維結構🧑🏻，如果能通過序列準確地（接近實驗精度）預測其結構👨‍👩‍👧‍👦，就可以 為該領域的研究提供很大程度上的幫助。

　　該項工作使用吳雲東課題組發展的RSFF2力場😁，可以準確地預測出20個環肽中的17個，與晶體結構的均方偏差（RMSD）小於1.1Å👩‍👩‍👧‍👦。新方法的準確度明顯高於之前的方法🌰☝🏿。另外⇢，他們還發現相對於線性多肽☝🏿🚏，環狀多肽的構象取樣與球蛋白更相似，為環狀多肽在藥物設計中作為蛋白分子的替代物提供了理論上的支持。

　　該論文第一作者為深圳研究生院化學生物學與生物技術學院博士研究生耿浩，蔣帆博士為共同通訊作者。